Thích thú khi thấy hai anh em vốn thù hằn nhau lại có thể hợp tác ăn ý đến vậy, Kabuto suy ra từ những câu trả lời của Sasuke rằng cậu bé ắt hẳn đã biết sự thật về Itachi sau khi anh mình chết. Chỉ ra sự đối nghịch trong mục đích của hai người, anh ta một lần nữa dụ dỗ Sasuke phản bội Itachi vì cậu và anh ta có chung mong muốn hủy diệt Konoha. Khi Sasuke từ chối, Kabuto thuật lại quá khứ gián điệp của mình và anh ta đã bị vứt bỏ như thế nào khi bản thân bắt đầu đánh mất danh tính của chính mình giữa muôn vàn những cái tên giả. Nhân vật này chốt lại rằng những gì mình đạt được chỉ là sự tủi nhục và danh dự bị vấy bẩn. Kabuto lí luận không ai hiểu Sasuke hơn anh ta, vì vậy, hãy cùng chung một phe và trở thành huynh đệ. Nhưng Itachi cảnh báo về tài giảo hoạt của nhân vật này. Sau đó, Kabuto bày tỏ lý do của mình và khoe khoang về sự hoàn hảo của Tạp giới chuyển sinh. Rồi ngay lập tức, anh ta dùng dao mổ chakra xông tới hai anh em trước khi giao chiến và đẩy lùi Itachi.

Sau khi tuyên bố anh em nhà Uchiha đã quá coi thường mình, nhân vật này dùng Tiên pháp: Vô cơ chuyển sinh để điều khiển địa hình hang động tấn công họ. Lúc Itachi bị trúng đòn vì bảo vệ cho Sasuke, Kabuto lấy ra một lá bùa từ con rắn của mình với mục đích xóa suy nghĩ của Itachi. Tuy nhiên, trước khi kịp làm chuyện đó thì Sasuke chặn anh ta lại bằng cách tạo một vòng lửa Amaterasu vây lấy cậu và Itachi. Đánh giá xong lựa chọn phòng thủ của Sasuke, Kabuto khẳng định họ không đời nào hạ được anh ta vì anh ta là người có sức mạnh gần với Lục đạo tiên nhân hơn bất kỳ ai.

Khi Itachi bảo Kabuto rằng anh ta rồi sẽ lại thất bại như trong quá khứ vì anh ta còn không biết mình thật sự là ai, thì nhân vật này đáp lại là cả cuộc đời đã cố gắng đi tìm bản thân theo cách của mình nhưng ngay từ đầu anh ta đã chẳng có gì cả. Nhớ lại về tuổi thơ của mình, Kabuto giải thích lý do nhắm vào hai anh em nhà Uchiha là vì muốn đồng nhất với sức mạnh của họ, vì những gì thuộc về các con cờ anh ta lợi dụng thì cũng thuộc về anh ta. Nhân vật này cũng hoàn toàn phủ nhận khi Itachi bảo cái tên Uchiha chả có nghĩa lý gì, và tiếp tục với cuộc công kích của mình.


Kabuto chặt đôi Itachi.Ngay sau đó, phiên bản cơ thể Sakon hiện ra từ con rắn ở rốn của Kabuto và anh ta dùng huyết kế giới hạn của cặp sinh đôi để sử dụng DNA thuộc về người khác trong cơ thể mình. Thân xác thứ hai này liền biến thành Jiroubou rồi làm nứt mặt đất đang chìm trong biển lửa trước mặt mình. Không hề dừng lại, Kabuto tiếp tục tạo ra Kidoumaru và dùng năng lực lưới nhện của hắn bẫy được hai anh em, dù họ đã đốt một phần mạng nhện không thể phá hủy này. Tiếp theo, anh ta dùng đến Kimimaro và chặn đường phía sau anh em nhà Uchiha khiến họ bị kẹp giữa mạng nhện và xương cốt. Trong lúc đó, Kimimaro dùng xương để tạo nên một cây sáo. Khi hai anh em vừa thoát ra, Kabuto dùng Tayuya biểu diễn ảo thuật dựa trên thính giác của cô làm tê liệt cả hai dù họ đang được bảo vệ bởi Susanoo. Cuối cùng, nhân vật này định dùng phiên bản hình dạng thật của Orochimaru để bắt giữ anh em nhà Uchiha. Tự tin vào lý tưởng và chiến thắng của bản thân, Kabuto rơi nước mắt khi nhìn họ đẩy lùi con rắn. Tuy nhiên, sau khi bất ngờ xuất hiện từ miệng của Orochimaru và chặt đôi Itachi, anh ta vừa khóc vừa bảo một thiên tài có tất cả sẽ chẳng bao giờ hiểu được khát khao đi tìm chính mình, rồi tuyên bố không ai có thể cản đường anh ta.


Dưới sự điều khiển của Itachi, Kabuto giải Thuật triệu hồi: Tạp giới chuyển sinh.Khi Kabuto di chuyển để xóa suy nghĩ của Itachi, anh ta bị Sasuke tấn công nhưng kịp thời bắt được thanh kiếm cậu phóng bằng cách dùng con rắn ở rốn mình. Sau đó nhân vật này rút lên trần hang động để tránh khỏi bị Susanoo của Sasuke bắt. Lúc anh ta dùng thuật Thủy độn: Đại bộc bố để dập cầu lửa của Sasuke (và cũng khiến cậu bị thổi bay), một Itachi vừa mới tái tạo tấn công anh ta. Kabuto chê Itachi vì đã dùng mưu kế tương tự như lúc chặt sừng của anh ta. Sau khi bác bỏ lý luận là vận mệnh của anh ta không nằm trong tầm kiểm soát của bản thân, Kabuto cảm thấy mình như đang trải nghiệm hiện tượng déjà vu. Vì vậy, anh ta quyết định chấm dứt trận đấu với việc tránh đòn từ Susanoo của hai anh em. Nhưng rốt cuộc nhân vật này cũng nhận ra bản thân đang chịu ảnh hưởng từ chiêu Izanami của Itachi và rằng anh ta đã trở thành tù nhân của chính tâm trí mình. Không thể chấp nhận sự thật mình đang bị giam trong vòng thời gian vô hạn và kế hoạch của bản thân đã đổ vỡ, Kabuto vừa gào thét chửi rủa Itachi vừa xông tới tấn công anh. Bên ngoài tâm trí Kabuto thì sau khi gỡ kính anh ta ra, Itachi niệm một ảo thuật khác lên nhân vật này để buộc anh ta tiết lộ thủ ấn cần thiết cho việc hủy bỏ Tạp giới chuyển sinh. Sau đó, Itachi điều khiển anh ta giải thuật. Kết quả đạt được là đạo quân Kabuto tạo ra cho Tobi biến mất, chỉ còn lại Madara vì ông ta đã hủy bỏ giao ước với người triệu hồi để tiếp tục tồn tại.


Orochimaru hút chakra của hắn từ cơ thể Kabuto.Lúc Sasuke quyết tâm dùng Thiên ấn chú của Anko với mục đích hồi sinh Orochimaru, Juugo giúp cậu bằng cách hấp thụ một phần xác thịt Kabuto để thuật có hiệu quả. Sau khi được hồi sinh, Orochimaru hút lại tất cả chakra từ cơ thể Kabuto. Việc này đảo ngược lại toàn bộ các biến đổi giống loài bò sát của Kabuto và biến anh ta trở lại hình dạng con người.

hay